于是杨嗣昌把已经认为完美的剿寇计划说了一遍。

其对策主要集中于前两点。

对于第一点，他认为天下大势好比人的身体，京师是头脑，宣、蓟诸镇是肩臂，黄河以南、大江以北的中原之地是腹心。

如今形势是烽火出现于肩臂之外，乘之甚急;流寇祸乱于腹心之内，中之甚深。

外患固然不可图缓，内忧更不能忽视，因为它流毒于腹心。

如果听任“腹心流毒，脏腑溃痈，精血日就枯干“，徒有肩臂又有何用呢?

所以他主张先与清朝和谈，稳住京师附近的局势，专心致志、一鼓作气的剿灭农民军。

对于第二点，他建议增兵12万，其中步兵74000人，马兵36000人。

并增加饷银280万两，采取均输、溢地、寄监学生事例、驿递四个途径。

杨嗣昌所提的三点纲领，都是为了实现他认为的“四正六隅、十面张网“的围剿计划来服务的。

这一计划的执行依靠的是五省总督洪承畴和五省总理王家桢的配合。

洪承畴已在围剿农民军的过程中颇建功勋，但王家桢被杨嗣昌认为是个庸才，不堪此任。

于是杨嗣昌向朱慈烺介绍，并推荐了两广总督熊文灿接替五省总理。

其实历史上杨嗣昌被崇祯皇帝任命为兵部尚书时也是如此做的。

杨嗣昌首先秘密启动议和行动。

崇祯十一年三月，辽东巡抚方一藻派瞽者周元忠出使沈阳，试探口风。

皇太极对其相当礼遇，并表示:“如有确议，则撤兵东归“。

杨嗣昌接到方一藻的报告后，立刻建议崇祯帝允许方一藻及总监太监高起潜便宜从事，办好议和，得到崇祯帝默许。

周元忠回到宁远，带回皇太极致高起潜的书信，信中称:“仍言讲款，若不许，夏秋必有举动。

杨嗣昌极力劝说崇祯帝把握时机与清和谈，但崇祯帝只命方一藻、高起潜“细酌“。

杨嗣昌不依不挠，继续上疏批评言官不顾兵部处境，只会空言误国，请求“圣鉴允行“，即明确批准方一藻与高起潜议和。

此时杨嗣昌主导议和已经公开化，引起朝臣激烈非议，掀起弹劾杨嗣昌运动。

其中攻讦最力的是少詹事黄道周，他们表面上反对杨嗣昌“夺情入阁“，实际上反对他主导的对清和议。

崇祯帝于当年七月五日召集群臣于平台，让杨嗣昌与黄道周在御前辩论。

最后崇祯帝袒护杨嗣昌，贬斥黄道周等弹劾杨嗣昌的官员。

尽管杨嗣昌摆脱弹劾，但崇祯帝碍于群臣反对，不敢接受杨嗣昌的建议。

对和谈明确支持，方一藻、高起潜与满清的和议遂不了了之。

同时，新被起用的兵部尚书卢象升亦坚决反对与清议和，与杨嗣昌形成尖锐对立。

皇太极见此情形，乃于崇祯十一年九月派兵大举入塞，对明朝展开惩罚性打击。

由于明廷内部政见分歧，总督天下援兵的卢象升受到杨嗣昌和高起潜的见死不救。

最终导致卢象升战死于巨鹿贾庄，七十余城先后失守，四十六万人被俘(包括德王朱由枢)。

到崇祯十二年三月清军方才扬长而去。

事后追究责任时，杨嗣昌虽被弹劾，但崇祯还是保住了他。